中科院研究生院其前身為中國科學技術大學研究生院（北京），1998年開始招收MBA研究生。2003年經國家教育部和國務院學位委員會批準正式以自主名義招收工商管理碩士（MBA）研究生，同年成立中國科學院研究生院MBA教育管理中心。MBA中心管理上主要依托于中國科學院研究生院管理學院，中心的整體教育管理模式沿襲研究生院的“院所結合”的辦學模式，充分利用研究生院、管理學院以及合作院所的豐富的教學和科研資源，在不斷整合社會各界資源過程中，始終保持持續創新發展。
    由《世界經理人周刊》和華爾街電訊網站聯合舉辦的中國MBA排行榜于2005年11月1日在上海揭曉，中國科學院研究生院管理學院榮登“中國最有影響力的MBA”排行榜第12位，與2004年排名第14位相比，本年度綜合排名上升了2位。同時揭曉的還有，管理學院院長成思危教授獲得2005年“中國最具影響力的10位管理學教授”第一名，中科院研究生院管理學院MBA榮獲2005年“中國最具發展潛力的MBA”第一名。